1．抑制有害菌的繁殖，使腸內菌叢保持正常。
拌料可抑制和阻止腸內有害菌的發生，使有益菌增加，恢復維持健康的腸內菌叢。主要是抑制病原大腸菌、梭狀芽孢桿菌、沙門氏菌、β溶血性類細菌等的繁殖。
2．產生消化酶，合成維生素可以產生淀粉酶和蛋白酶等消化酶以及維生素B群，另外維生素A的合成也已被證實。
3．增強免疫作用，通過刺激腸道內免疫細胞，增加局部抗體的形成，從而增力。巨噬細胞活性。微生物飼料添加劑中有增強免疫作用
的維生素A。
4．產生過氧化氫，過氧化氫對幾種潛在的病原微生物均有損害作用，它是由一些特殊的物質在一些基質上形成的。
養豬方面的幾個案例：
飼養效果 產前母豬對其用微生物飼料（如：EM原露），可使母豬采食量加大，消化改善，增大泌乳量，能有效地控制母豬便秘等不良癥狀。母豬產下子豬死胎數大大減少，子豬毛色光潤，體形均勻，生長整齊，子豬的初生重有明顯提高（6％~8％）。
哺乳子豬： 子豬產下后腸道內定居的微生物主要源自母體，母豬食用微生物飼料（如：EM原露）后，子豬腸道內有益菌群的大量擴繁起主導作用，可有效控制病原菌的生長，從而對子豬的早發性及近發性大腸桿菌病即黃白痢，有十分明顯的控制作用。
