EM原露在錦鯉養殖中的使用方法通常采用配餌投喂， EM原露配餌投喂對于錦鯉的體長和體重生長均有促進作用。與對照組相比，采用EM原露配餌投喂法，錦鯉的平均日增長和平均日增重分別提高22.55％和43.25％。
在水產養殖中，往水體直接投施EM原露可以凈化水質，提高水體溶氧量，改善水生生物的生長環境，從而促進養殖生物生長。而EM原露配餌投喂進入魚體后，微生物本身含有的蛋白質、維生素等營養物質可以被魚體直接吸收；EM原露可與腸道內的有益菌相互協同，抑制和消滅致病菌群，并合成大量蛋白質、糖類等營養物質；EM原露還能增強腸道活動能力，提高蛋白質的利用率。用EM原露作為飼料添加劑養殖錦鯉，發現EM原露能提高魚體血液中的紅細胞和血紅蛋白含量，降低耗氧量，可以增強魚體的體質和抗病力。因此采用EM原露配餌投喂后作用的效果要優于直接在水體中投施EM原露。